Gmina powstała w 1993, z przekształcenia istniejącej w latach 1946–1993 Kongregacji Wyznania Mojżeszowego we Wrocławiu w Gminę Wyznaniową Żydowską. 27 sierpnia 2006, z powodów finansowych, Gmina została włączona w strukturę organizacyjną Związku Gmin Wyznaniowych Żydowskich w RP jako jego oddział[2]. Od 2018, Gmina Wyznaniowa Żydowska we Wrocławiu ponownie funkcjonuje samodzielnie.
Gmina przez wiele lat posiadała trzy filie w Dzierżoniowie (ul. Krasickiego 11), Wałbrzychu (ul. Mickiewicza 18) i Żarach (ul. Zaułek Klasztorny 3). Filia w Dzierżoniowie została zlikwidowana pod koniec lat 90., filia w Żarach i istniejący tam dom modlitwy w 2007, a filia w Wałbrzychu i istniejący tam dom modlitwy po śmierci Ludwika Hoffmana w 2010.
