Naudé pracował m.in. dla kardynała de Bagni i Francesco Barberini w Rzymie, a następnie dla kardynała Mazarine w Paryżu. Dla tego ostatniego stworzył znaczny księgozbiór, który stanowi bazę współczesnej bibliothèque Mazarine w stolicy Francji. Proces ten trwał 10 lat, podczas których Naudé podróżował po Europie wraz z kardynałem, zebrawszy w ten sposób ponad 40 000 dzieł, w tym wiele cennych manuskryptów.
Publikacje
Le Marfore, ou Discours contre les libelles. Quæ tanta insaniæ, cives ?, Paris, L. Boulenger, 1620, 22 s. dostępne na stronie Gallica
Instruction à la France sur la Vérité de l'Histoire des Frères de la Roze-Croix... Paris, Chez François Julliot, 1623. Nouvelle édition : Instruction à la France sur la vérité de l'histoire des Frères de la Roze-Croix (1623), wstęp, redakcja i anotacje przez Didier Kahn, Paris, Champion, 2009.
Advis pour dresser une bibliothèque. pierwsze wydanie w 1627, reedycja w 1644. Wydanie współczesne: Klincksieck, 1994. - 164 s.
Addition à l'histoire de Louis XI. Wydanie pierwsze w 1630. Wydanie współczesne: Fayard, 1999. - 196 s.
Science des Princes, ou Considérations politiques sur les coups-d'état. Wydanie pierwsze 1639. Wydanie współczesne: Le Promeneur..
Quinque quaestionum latro-philologicarum / Gabriel Naudé. - Parisiis, Chouet, 1647.
Causae Kempenses conjectio pro curia Romana / Gabriel Naudé. - Parisiis, Cramoisy, 1651.
Apologie pour tous les grands personnages qui ont esté faussement soupçonnez de magie.1625, La Haye, Adrian Vlac, 1653.
Bibliographia Militaris. In germania primum edita cura G. Schubarti. Ienae, ex Officina Nisiana, 1683.
Naudaean et Patiniana ou Singularitez Remarquables, Prises Des Conversations De Mess. Naudé & Guy Patin. Drugie wydanie poprawione i wzbogacone przez Additions au Naudæana, Amsterdam, François vander Plaats, 1703.
Science des princes, ou Considerations politiques sur les Coups d’État. Avec les Réflexions Historiques, Morales, Chrétiennes, & Politiques. De L.D.M.C.S.D.S.E.D.M. 3 tomy. 1752. Réflexions Historiques... autorstwa Louisa du Maya, doradcy i sekretarza Sérénissime Electeur de Mayence, na co wskazują tytułowe inicjały.
Mémoire confidentiel adressé à Mazarin. Après la mort du cardinal de Richelieu., opublikowane przez Alfreda Franklina na podstawie manuskryptu.
