Jest autorem licznych rozpraw i traktatów naukowych. Szczególnie znane są wydane drukiem: wykłady z metafizyki oraz pierwsze w Polsce kompendium wiedzy o żegludze i nawigacji "Brevis commentatio nautica".
Systema disciplinae politicae publicis praelectionibus anno MDCVI propositum in Gymnasio Dantiscano, Hanoviae 1608
De natura et proprietatibus historiae commentarius privatim in Gymnasio Dantiscano propositus ..., Hanoviae 1610
Disputationes publicae speciales et extraordinariae quatvor, quarum: I De Principatu sive Monarchia Persarum. II. De sexaginta Rebuspublicis Priscis. III De Republ. Atheniensi. IV De Republ. Spartana, habitae in Gymnasio Dantiscano ad methodum accuratam, quae ostensa est in Politicis, Hanoviae 1610
Systema systematum clarissimi viri Dn. Bartholomaei Keckermanni omnia huius autoris philosophica uno volumine comprehensa lectori exhibens, idque duobus tomis, quorum prior disciplinas instrumentales sive propedeuticas una cum tractatibus ad eos pertinentibus complectitur, posterior ipsam paediam philosophicam sive scientias et prudentias ... continet una cum adiunctis disputationibus et commentationibus, quibus una vel altera systematis alicuius pars et materia ab auctore fuit illustrata, Hanoviae 1613
Dispositiones orationum, sive collegium oratorium de rebus variis et cognitione dignis, annis abhinc aliquot exercitii caussa, tum publice, tum privatim propositum in Gymnasio Dantiscano a clarissimo viro..., Hanoviae 1615
Bronisław Nadolski: Życie i działalność naukowa uczonego gdańskiego Bartłomieja Keckermanna : studium z dziejów odrodzenia na Pomorzu. Toruń: TNT, 1961. Brak numerów stron w książce
Danilo Facca: Bartłomiej Keckerman i filozofia. Warszawa: Wydawnictwo Instytutu Filozofii i Socjologii PAN, 2005. ISBN 83-7388-073-9. Brak numerów stron w książce