Bagienna Dolina Drwęcy zajmuje duże zakole rzeki powyżej Brodnicy. Szerokość doliny na tym odcinku wynosi od 0,5 do 3 km, ma ona naturalny charakter, rzeka silnie meandruje, a jej korytu towarzyszą starorzecza i sieć kanałów. Otoczona jest stromymi zboczami, które w większości są zalesione. Dno doliny jest płaskie, bagniste, wiosną zalewane wodami Drwęcy. Oprócz chronionych w Unii Europejskiej łąk trzęślicowych dno zajmują trzcinowiska i turzycowiska. Dużą część doliny porastają zbiorowiska wierzb, olsy, łęgi i bory sosnowe. W obszarze chronionym znajdują się również dolne odcinki Brynicy i Samionki oraz jeziora Sopień i Ostrów[1].
Na terenie Bagiennej Doliny Drwęcy stwierdzono występowanie 43 gatunków ptaków wymienionych w załączniku nr 1 dyrektywy ptasiej[3], głównie ptactwa wodnego i wodno-błotnego. Populacja zatrzymujących się tu ptaków wodno-błotnych sięga 20 tys. Spośród nich w trakcie migracji i lęgów licznie występują m.in.:
Największym zagrożeniem dla gniazdowania ptaków jest zarastanie łąk i mokradeł w dolinie. Zagrożeniem jest też zalesianie, obniżenie poziomu wód gruntowych, działania z zakresu ochrony przeciwpowodziowej oraz zwiększenie zabudowy[1].
W centralnej części Nadleśnictwa Brodnica, w miejscowości Bobrowiska znajduje się przyrodniczo-leśna ścieżka dydaktyczna. Przeznaczona jest wyłącznie do ruchu pieszego, dostępna jest przez cały rok. Jej długość to ok. 800 m, zaczyna się i kończy w tym samym punkcie. Wzdłuż trasy znajduje się wiata, liczne tablice tematyczne oraz wieża widokowa[4].