Slekten Vågen stammet fra, kom fra Onarheim og Myklebust. Han tok misjonsskolen og cand.theol.-utdannelse og ble forkynner i NLM og lærer på Fjellhaug ved Oslo fra 1931. I 1932 giftet han seg med Arna Vågen. Vågen var generalsekretær i NLM 1936-1970, og ble betraktet som en dyktig misjonsstrateg og leder. Han var med i mange styrer og råd, også utenfor NLM. Forfatter av mange bøker, bl.a. I livsens vår, I kongens nærhet (andaktsbok), Når øst og vest møtest, Sol på skyggesiden, I Hans fotspor, Slaget om Asia, Sol og solflekker i sollandet. Han var medlem av den hemmelige kirkeledelse under krigen, og utsending til internasjonale misjonsmøter.
I Tormod Vågens periode ble misjonsorganisasjonens navn endret til Norsk Luthersk Misjonssamband.