Thomas O’Callaghan ble født i Sullivan's Quay i Cork, til Michael O'Callaghan og hans hustru Margaret Palmer, begge fra Cork. Han ble utdannet ved North Monastery CBS, O'Connor's school, Sunday's Well, og senere O'Sullivan's classical school, South Mall og ved St Mary's grammar school i Pope's Quay.
Basilica di San Clemente al Laterano
Dominikanerprest
O'Callaghan ble videre utdannet for prestetjeneste ved Collegio Minerva i Roma. Han tok doktorgrad i teologi og ble prest i dominikanerordenen i Viterbo i juli 1863 av byens erkebiskop, kardinal Gaetano Bedini.
Da han kom tilbake til Irland, underviste han i filosofi i seks år ved Tallaght, samtidig som han underviste ordenens noviser der. Han var i Cork i 1870 da han fikk kopper, ble frisk i 1872, og ble prior for dominikanernes hus i Galway og i St Catherine's i Newry i 1874.
Han ble kalt til Roma og ble novisemester og lektor ved basilikaen San Clemente i Roma, og innehadde dette embedet fra 1870 til 1880. Han hadde sterke personlige og sjelesørgeriske forbindelser i romerske kretser gjennom sitt vennskap med kardinal Alessandro Barnabò, kardinalprefekt for Propaganda Fide, og var en tid personlig skriftefar for pave Pius IX.
Fra februar til august 1880 var han igjen prior i Newry.
Han ble dominikanernes prior ved basilikaen San Clemente i Roma i 1881.
Biskop Delany ønsket ikke sin koajutor velkommen, og han ble henvist til å bo sammen med søstrene sine, Margaret og Hannah, på 34 South Mall, Cork, avhengig av dem for livsopphold.
Biskop av Cork
Han ble biskop av Cork den 14. november 1886 og innført i embedet den 3. desember samme år.
O'Callaghan utstedte et hyrdebrev i februar 1901 der han advarte mot farene ved sosialisme, som slik han så det var basert på «falsk filosofi» og «gale moralprinsipper». Under sin bispetid bygde han nye kirker og forbedret gamle, og utvidet katolske skoler. Han grunnla også St Angela's High School for jenter på St Patrick's Hill.
Fra 1908 var han engasjert i å fremme saligkåringsbestrebelsene for Nellie Organ (1903–1908), et fromt og helgenaktig barn.
