Philip Ernst var sønn av hertug Christian og Agnes av Slesvig-Holsten-Sønderborg-Pløn. I 1686 fikk han av den danske konge tildelt en pensjon på 1000 riksdaler som ble fordoblet i 1689 og stadig ble utbetalt i 1693. I 1689 studerte han i Genève og Turin. Den 19. april samme år ble han ved operahusets brann på Sophie Amalienborg i København reddet ut av flammerne av sin hoffmester Limburg (som selv omkom).[6]
I 1692 deltok han i felttoget i Flandern og var med i slaget ved Steenkerke. Hjemvendt samme år ble han utnevnt til kaptein i prins Christians regiment, deltok året etter i beleiringen av Ratzeburg, ble i 1694 major, 1695 oberstløytnant og var igjen i Flandern til han ved freden i Rijswijk vendte hjem.
Ved farens død i 1698 arvet Philip Ernst det lille hertugdømmet omkring Glücksborg slott, hvortil han kjøpte ekstra gods. Han døde den 12. november 1729 på Glücksborg, og ble etterfulgt som hertug av sønnen Frederik (1701–1766).
^abThe Peerage, oppført som Philip Ernst Herzog zu Schleswig-Holstein-Sonderburg-Glücksburg, The Peerage person ID p586.htm#i5851, besøkt 9. oktober 2017[Hentet fra Wikidata]
,_Herzog_von_Schleswig-Holstein-Sonderburg-Gl%C3%BCcksburg.jpeg)
