Peräseinäjoki er en tidligere kommune i landskapet Södra Österbotten i Finland. Kommunen hadde 3 698 innbyggere i 2002, og arealet var 445 km². Peräseinäjoki var en finskspråklig kommune.
Den 1. januar 2005 ble Peräseinäjoki kommune slått sammen med byen Seinäjoki.