Han var prestesønn og vokste opp i Øyer. Han giftet seg med sin kusine Brgitte Marie Irgens og de fikk én datter.[2] Han ble student i 1822, cand.theol. 1827 og kapellan på Fåberg fra 1828. Han ble sogneprest i Trysil 1830, residerende kapellan i Kristiansand i 1842 og sogneprest i Røyken fra 1849. Mens han bodde i Trysil var han også den første ordføreren i Trysil 1837–39.
Dypdahl var inspirert av vekkelseskristendom, var positiv til haugianismen og samarbeidet godt med haugianske legpredikanter mens han var i Trysil.[3][4]
