Herregården er den første i Danmark i barokk og er oppført i røde mursten samt i sandsten med rødt tegltak. Den er omgitt av en vollgrav på opprinnelig fire, men siden 1780-årene tre sider. Fra 1809 inntil lensavløsningen var herregården sentrum for Baroniet Stampenborg.
(1990–2010) Peter Stampe Holst / Marianne Themsen gift Stampe Holst
(2010–) Marianne Themsen gift Stampe Holst
Fredning
Nysø ble fredet i 1918, fredningen utvidet i 1964. Fredningen omfatter hovedbygningen, Thorvaldsens verksted pluss tre andre bygninger med omgivelser.
[1]