Referanseløs: Denne artikkelen inneholder en liste over kilder, litteratur eller eksterne lenker, men enkeltopplysninger lar seg ikke verifisere fordi det mangler konkrete kildehenvisninger i form av fotnotebaserte referanser. Du kan hjelpe til med å sjekke opplysningene mot kildemateriale og legge inn referanser. Opplysninger uten kildehenvisning i form av referanser kan bli fjernet.
Systemet består av 24 forskjellige ruter, inkludert tre korte skyttelruter. Hver rute har en egen farge, og identifikasjon som består av et tall eller en bokstav. Fargen bestemmes av rutens trasé gjennom det sentrale Manhattan. Linje G trafikkerer ikke Manhattan i det hele tatt, og har fått en limegrønn farge. De tre skytteltogene (kalt linje S) kjennetegnes av en mørk gråfarge.
Enkelte ruter kjører ekspress på deler av strekningen. Undergrunnsbanen er åpen hele døgnet, men rutene kan forandre seg noe i løpet av natten, slik at ruter som normalt kjører ekspress stopper ved alle stasjoner på nattetid for å erstatte rutene som ikke kjører hele døgnet. Linjene J og Z følger et såkalt "skip-stop"-mønster i rushtiden, slik at de hopper over annenhver stasjon (J betjener stasjonene som Z hopper over og vice versa). Tabellen under viser hovedsakelig kjøremønsteret som følges på dagtid hverdager.
