Pesce ble utnevnt til visesentralbanksjef i Argentinas sentralbank 23. september2004.[3]
Da sentralbanksjef Martín Redrado ble avsatt i januar 2010, etter en konflikt med president Cristina Fernández de Kirchner, overtok Pesce midliertidig som sentralbanksjef.[4] Den 3. februar 2010 ble Mercedes Marcó del Pont utnevnt som ny sentralbanksjef, og Pesce gikk da tilbake til sin stilling som visesentralbanksjef. Han var visesentralbanksjef fram til 2015, da han gikk ut av sentralbanken, for å lede Banco de la Provincia de Tierra del Fuego. Denne stillingen hadde han fram til desember 2019, da han ble utnevnt til sentralbanksjef.[5]