Den 2. mai 1980 utnevnte pave Johannes Paul II ham til biskop av Agrigento og den 1. juni 1988 utnevnte ham til erkebiskop av Catania. Den 14. september samme år ble han innført i embedet. Med opphøyelsen av erkebispedømmet i Catania til metropolitanerkebispedømme i 2000, ble han den første metropolitan for kirkeprovinsen Catania.
Den 6. august 2002 aksepterte pave Johannes Paul II Bommaritos avskjedssøknad. Han mosatte seg etterpå i hjembyen Terrasini.