Rykkja ledet det EU finansierte prosjektet TROPICO Transforming into Open, Innovative and Collaborative Governments om krisehåndtering og kapasitetsbygging i offentlig sektor. Arbeidet med dette prosjektet gjorde at Rykkja i 2021 havnet på Apolitical sin liste over akademikere med mest påvirkning på stater og regjeringer verden rundt.[4]
I sin forskning har Rykka særlig vært interessert i spørsmål knyttet til fagområdet offentlig forvaltning og politikk, mer spesifikt digital forvaltning og krisehåndtering.
I 2021 ble Lise Hellebø Rykkja valgt til leder for Institutt for administrasjon og organisasjonsvitenskap. Instituttet skiftet 1. august 2022 navn til Institutt for politikk og forvaltning under ledelse av henne.