Etter eksamen fra videregående begynte han å studere teologi i Lwów i 1878. Etter å ha mottatt lavere vielser i 1881, ble han av sendt for videre studier av erkebiskop Franciszek Ksawery Wierzchleyski til Gregoriana i Roma for videre studier.
Prest
I Roma ble han ordinert til prest 24. mars 1883. 9. juli 1884 tok han doktorgraden i teologi.
Han var først prefekt, deretter nestleder ved seminaret i Lwów, og virket også som notarius ved matropolitandomstolen og underviste i teologi og filosofi.
Biskop av Tarnów
Den 15. april 1901 utnevnte pave Leo XIII ham til biskop av Tarnów. Han ble ordinert til biskop av biskopen av Kraków, kardinal Jan Puzyna de Kosielsko, den 12. mai 1901; medkonsekratorer var Józef Bilczewski, erkebiskop av Lwów, og Joseph Weber, hjelpebiskop i Lwów. Hans spesielle interesse var presteopplæring og pastoral omsorg i bispedømmet hans.
Den 4. mai 1932 måtte han trekke seg av helsemessige årsaker. Pave Pius XI utnevnte ham til titulærbiskop av Tlos og et år senere titulærerkebiskop av Oxyrynchus.
Leon Wałęga trakk seg tilbake til redemptoristklosteret i Tuchów den 15. mars 1933, han døde kort tid senere og ble gravlagt der.