Den 1. januar 2018 hadde kommunen 143 innbyggere, fordelt på bygdene Kunoy og Haraldssund.[1] Det har vært veiforbindelse mellom bygdene og til Klaksvík by med tunneler og landfyllinger siden 1980-årene.
Ved innføringen av det kommunale selvstyret på Færøyene i 1872 ble øya en del av Norðoya prestagjalds kommuna. I 1908 ble prestegjeldskommunen delt, så den vestre delen kom til å danne Kunoyar, Mikladals og Húsa kommuna. I 1931 ble kommunen igjen delt i tre, så Kunoy oppstod som egen kommune.[2][3]