Nobelkomiteen begrunnet tildelingen av prisen med blant annet følgende:
Hva gjorde Wagner-Jauregg for å bøte de ulykkelige ofrene for denne fryktelige sykdommen? Det finnes et ordtak som lyder 'ondt skal med ondt fordrive' som kan angis som motto for hans behandling av [nevrosyfilis-]forlamming. Han bøtet de mentalt angrepne pasientene gjennom å infisere dem med en annen sykdom – malaria.