Den siste posteringen før han ble biskop var formelt til Filippinene (med oppdrag i Hongkong).
Fra mai 1989ble Gobel den første av en relle pavelige diplomater som ble postert til Hongkong for å studere på nærmere hold den katolske kirkes kår i Folkerepublikken Kina og utsiktene for at det på lengre sikt kunne etableres diplomatiske forbindelser mellom Den hellige stol og Beijing.[1][2] (Gobel ble etterfulgt i Hongkong av Fernando Filoni i 1992 og Eugene Nugent i 2001.) Mens han var basert i Hongkong besøkte han Mongolia etter innbydelse fra regjeringen der for å se på muligheten for å etablere et misjonsnærvær der; dette førte til at kongregasjonen Congregatio Immaculati Cordis Mariae fikk et slikt oppdrag.[3]
Den 5. januar 2013 ble han av Benedikt XVI utnevnt til apostolisk nuntius til Egypt og utnevnt til delegat for Den hellige stol til Den arabiske liga. I tillegg fikk han en rolle ved å gjenopplive den langvarige dialogprosessen med det islamske Azhar-universitetet.[4] Han innehadde embedet som apostolisk nuntius frem til 3. januar 2015.
Etter den diplomatiske tjeneste
Da han kom tilbake til sitt hjembispedømme Annecy, overtok han sogneprestansvar i Abondance i Alpene mens han lærte opp sin etterfølger. Siden 1. september 2016 har han tjenestegjort i bispedømmet.