Jensen var født og oppvokst på Rise i Sortland. Han var president i Norges Skiforbund fra 1995 til 2002. Før dette var han leder for Østfold skikrets og idrettskrets. Jensen var også andre visepresident i Norges Idrettsforbund 1994-95 og styremedlem i idrettsforbundet til 1999, da han stilte som kandidat til vervet som president i idrettsforbundet men tapte avstemningen mot Kjell O. Kran.[1]
Med Jan Jensen som president ble Norges skiforbunds økonomi snudd fra konkursbo til solid overskudd.[2]
