Filip startet sin karriere som 12-åring i den lokale klubben Dukla Praha, før han i 1997 signerte for den tyske klubben Düsseldorf. Etter kun én sesong i Tyskland flyttet han tilbake til Praha, før han signerte for den italienske klubben Pallamano Conversano i 1999.
I år 2000 forsøkte Filip på nytt lykken i Tyskland og signerte for Nordhorn, hvor han ble i åtte år. Som én av Bundesligaens mest målfarlige spillere, scoret han i løpet av sin tid i Tyskland 1 792 mål i ligaen, som også inkluderer én sesong i Rhein-Neckar Löwen.[3]