Jørgen Erik Skeel (født 4. februar1737, død 11. januar1795) var en dansk embetsmann og statsminister.
Han er særlig kjent fordi han var med i en kommisjon nedsatt etter Struensees henrettelse hvor man gikk igjennom hvilke av hans kabinettsordre man skulle beholde og hvilke som skulle endres.
Skeel hadde tidligere i sin karriere blant annet vært stiftamtmann over Bergens stift og amtmann i Søndre Bergenhus.
Etter regjeringsforandringen i 1784 ble han utnevnt til stiftamtmann i Akershus Stift og amtmann i Akershus Amt