Departementet Izabal omgir Lago Izabal (eller Lago de Izabal), Guatemalas største innsjø (omkring 48 km lang og 24 km bred, med et areal på ca. 590 km²). Det spanske kolonifortet San Felipe, nå et guatemalansk nasjonalmonument, med utsikt over stedet der innsjøen danner Río Dulce.
Den lille byen Izabal ligger ved kysten av innsjøen i sør; før byggingen av havnene Livingston og Puerto Barrios i det 19. århundre var den Guatemalas hovedhavn til Det karibiske hav og var opprinnelig sete for Izabal departement; men nå er Izabal by er fjerntliggende landsby som får liten trafikk.
Fra området rundt innsjøen Izabal, strekker departementet Izabal seg langs Río Dulce til kysten av Det karibiske hav.