Han var sønn av amtmannPreben von Ahnen og arvet ved dennes død i 1675 store jordeiendommer over det ganske land, de fleste etterhvert solgt. I 1691 flyttet han til Molde, der han var amtmann i Romsdals amt frem til 1700[2] og ble kjent for sitt engasjement for lokalmiljø og kirken. Han kjøpte 1 pund 3 våger fiskeleie i offisersgården Molde (senere kalt Moldegård).[3]
Iver von Ahnen ble 9. oktober1700 utnevnt til stiftamtmann i Trondhjems stiftamt, hvor han virket frem til sin død. I nødsårene rundt 1701 undertegnet han: «Den 6. april tillot jeg Romsdalens borgere å fare på Bergen med sild», en uttalelse som muliggjorde de nødvendige forsyninger som hadde uteblitt etter strid mot trondhjemskjøpmenn.
Han døde 1722 i Trondhjem og ble gravlagt ved domkirken.
^Overrettssakfører Jørgen Olafsen-Holm (red.), Bolsøyboka. En natur- og samfunnshistorisk skildring av Bolsøy prestegjeld og herred: første del. Bolsøybygdas natur og eldre historie ([1939]. 2. opplag ved Bolsøyboknemnda, Molde 1976): s. 336