Omkring opprettelsen av Hamarøy som eget prestegjeld råder det noe usikkerhet. Hamarøy ble muligens eget pastorat ved kgl.res. av 1. april 1740, om at kapellanier som lå langt fra dem de var benefisert, skulle være egne pastorat,[5] men det er usikkert om dette gjorde Hamarøy til eget prestegjeld.[6][Hammerø] Præstegjeld hørte længe som et residerende Pastorat under Stegen, hvorfra det blev skilt ved [kgl.res. av] 9. juni 1809, og indbefatter eet Sogn med een Kirke.[7] Dette reskriptet har ingen slik bestemmelse, men sier at Hamarøy residerende pastorat ved den nåværende vakanse i Steigen sognekall må få tilbake de tiendeinntektene som lå til Steigen, men som før hadde ligget til Hamarøy. Hamarøy var vel et av de kapellanier som ble egne pastorat eller sognekall som følge av reskriptet 1. april 1740.[6]
Ved kgl.res. av 28. oktober 1882 ble det bestemt å rive den eksisterende kirken og oppføre en ny Hamarøy kirke, og ved kgl.res. av 19. september 1885 ble det tillatt å flytte Hamarøy gamle kirke til gården Karlsøy som et kapell for Sagfjorden.[6]
Fra 2004 ble prestegjeldene som administrativ enhet faset ut av Den norske kirke, og fra 2012 gikk de også ut av lovverket.[9]
Menigheter
Prestegjeldet hadde ved sin avvikling følgende menigheter:[10]