Ingen kommuner ønsket under kommunereformen 2005–07 å gå sammen med Farum kommune pga. Farum-saken og Farums dårlige økonomi, men både Værløse og Farum var så små at de ble tvunget sammen av forlikspartiene, dog med en økonomisk kompensasjon på 50 millioner danske kroner årlig frem til 2021.
I mars 2007 ble det besluttet å frede Flyvestation Værløse, som var gitt til kommunen som del av den økonomiske kompensation etter Farum-saken.
Lokalpolitikk
Byrådet
Byrådet i Furesø kommune hadde 25 medlemmer i 2007. Den tidligere borgmesteren i Værløse kommune, Jesper Bach(V), ble kommunens første borgmester.
Kommunalvalget 15. november 2005 ga følgende mandatfordeling:
Mandatfordeling i Furesø etter valget 15. november 2005