Francis Dougan oppnådde først en grad i jus og senere en lisensiat i kanonisk rett. Den 27. juni 2001 mottok han ordinasjonssakramentet av biskop John Devine for Motherwell bispedømme.[2]
Etter ordinasjonen var Dougan først som prest for Our Lady and St. Anne Parish i Hamilton og som kapellan ved Holy Cross High School der, før han ble viserektor ved Pontifical Scots College i Roma i 2006. Etter hjemkomsten var han sogneprest i menighetene St. Mark og St. Anthony i Rutherglen og som kapellan ved Trinity High School i Hamilton fra 2013 til 2021. Fra 2021 var han sokneprest for Our Lady of Lourdes Parish i East Kilbride og kapellan ved Hairmyres General Hospital der. og ved St. Andrew's og St. Bride's High School der. I tillegg virket som sogneprest, fungerte Dougan også som konsultor fra 2013 og som visefunksjonær ved den interbispedømmedomstolen for de skotske bispedømmene fra 2017. Han var også official i Motherwell bispedømme fra 2017.[2]