Aloneftis startet sin fotballkarriere hos AC Omonia, hvor han fikk sin seniordebut i førstelagstroppen under 2000/2001-sesongen. Frem til sommeren 2005 spilte han 71 seriekamper for klubben og scoret 18 mål, og var med på å vinne den kypriotiske supercupen LTV Super Cup (2001), serien (2003) og den kypriotiske fotballcupen (2005). Den 22. juni 2005 meldte han overgang til den greske klubben Larissa.[1] Han etablerte seg raskt på førstelaget, og under 2006/2007-sesongen var han med på å spille laget frem til finalen av den greske fotballcupen, hvor Larissa slo Panathinaikos 2–1.[2]
Den 31. mai 2007 ble Aloneftis Bosmannspiller og valgte å skrive under på en kontrakt med den tyske klubben Energie Cottbus på en fri overgang.[3] Han spilte kun én sesong i klubben og fikk med seg 12 seriekamper i Bundesligaen i 2007/2008-sesongen før han i juni 2008 returnerte til Omonia og skrev under på en femårskontrakt.[4] I sin andre periode i klubben var han en sentral del av laget som vant seriemesterskapet i 2010, to cupmesterskap (2011 og 2012) samt supercupmesterskapet i 2010.
Den 1. juni 2012 ble Aloneftis og Omonia enige om å avslutte kontraktforholdet[5], og kun en uke etterpå skrev han under på en treårskontrakt med serierivalen APOEL. I sin første sesong var han med på å hjelpe klubben til å vinne seriemesterskapet for 2012/2013-sesongen.
Landslagskarriere
Aloneftis fikk sin landslagsdebut for Kypros i en VM-kvalifiseringskamp mot Sveits den 30. mars 2005, en kamp som endte 0–1.[6] Hans første mål for Kypros kom i returoppgjøret i samme kvalifisering mot Sveits den 7. september samme år.[7] Siden debuten har han deltatt på landslaget under flere kvalifiseringer til både europamesterskap og verdensmesterskap.
