Butler er homofil, og er i dag gift med Richard Waterhouse. Han skrev enmannsshowet The Only Thing Worse You Could Have Told Me, hvor han kom ut av skapet offentlig. Showet består av ti rollefigurer som diskuterer hva «homofili» betyr. Han ble nominert til en Drama Desk Award for arbeidet.
I 2009 spilte han i TV-filmen Prayers for Bobby som var basert på boken Prayers for Bobby: A Mother's Coming to Terms with the Suicide of Her Gay Son, som igjen var basert på virkelige hendelser.[3] Filmen handler om Mary Griffith (Sigourney Weaver), en kristen kvinne som oppdrar barna sine i den evangelikalske tro. Hun benekter at sønnen sin er homofil, og ber han om å gå til en psykolog for å bli «kurert». Imidlertid blir han mer deprimert, og ender opp med å flytte til Portland hvor han blir forelsket i en gutt. Etterhvert begår han selvmord, og Marys verden snus opp ned. Butler spilte presten Griffith oppsøker for å finne fred i sjela med hva som har hendt.
.jpg)
