Babington ble utdannet av sin far, Matthew Drake Babington, og studerte senere under orientalisten og arkeologen Charles Wycliffe Goodwin da han begynte på St. John's College, Cambrigde i 1839. Han ble uteksaminert i 1843. I 1845 fikk han Hulsea prisen for essayet sitt, The Influence of Christianity in promoting the Abolition of Slavery in Europe. Han ble ferdig med sin mastergrad i 1846, og med sin PhD i 1879.
Babington var også forfatteren av Mr Macaulay's Character of the Clergy (1849), et forsvar av presteskapet i det 17. århundre. Han skrev også ut editio princeps av Hypereides taler mot Demosthenes (1850), On Behalf of Lycophron and Euxpenippus (1868) og Funeral Oration (1858).
I 1855 publiserte Churchill Babington en ny utgave av Benefizio della Morte di Crito, en bemerkelsesverdig bok om reformasjonen.
Virke som arkeolog
Fra 1865 til 1880 holdt han Disney professoratet i arkeologi ved Cambridge. I sine foredrag, illustrert av sin egen samling av mynter og vaser, holdt han hovedsakelig på med gresk og eldgammel romersk keramikk og numerastikk.
Churchill Babington skrev om mange forskjellige emner. Hans tidlige kjennskap til landlivet fikk han til å interessere seg innen naturhistorie, særlig botanikk og ornitologi. Han var også en autoritet innen conchologi, og var forfatter av delvis av botanikk-vedlegget og ornitologi-vedlegget i Potters History and Atiquities of Charnwood Forest (1842).
Skrifter i utvalg
Mr. Macaulay's character of the clergy in the latter part of the seventeenth century. London 1849
