Bremsnesfjorden er en fjord i Averøy og Kristiansund kommuner på Nordmøre. Fjorden strekker seg 11 kilometer fra Norskehavet i sydlig retning mellom Averøya på vestsiden og Kirklandet, Innlandet og Frei på østsiden. Innenfor Sildvoldneset på Frei fortsetter fjorden som Kvernesfjorden videre innover.

Fjorden har innløp fra Norskehavet mellom Øksenvågen i vest og Meldalsholmen ved Kristiansund i øst. Kristiansund by ligger på østsiden av fjorden. Like innenfor innløpet går Brunsvikbukta inn til Brunsvika på Kirklandet og litt lenger sør går Sørsundet inn til sentrum av byen på nordsiden av øyen Innlandet. Mellom Innlandet og Frei, som inntil 2008 var egen kommune, ligger Bolgsvaet. På Frei går Møstavågen inn til bygden Møst.^[1]

På Averøya ved fjorden ligger Bremsnes, som fjorden er oppkalt etter.

I desember 2009 ble det åpnet en tunnel mellom Averøy og Kristiansund under Bremsnesfjorden.