Issahaku har tidligere jobbet i Verdensbanken, og var administrerende direktør (CEO) i Export Development and Agricultural Investment Fund (EDAIF) fram til han ble utnevnt til visesentralbanksjef i 2013. Han var også direktøør i sentralbanken, med ansvar for ni avdelinger, bl.a. økonomi, statistikk, forskning, jus og bankovervåkning.
Da Henry Akpenamawu Kofi Wampah gikk av som sentralbanksjef ble Issahaku utnevnt til hans arvtaker, og han overtok stillingen 1. april 2016.