De Zwitserse voetbalbeker 2003/04 (Duits: Schweizer Cup 2003/04) was de 79ste editie van dit Zwitserse voetbalbekertoernooi. Het begon op 20 september 2003 en eindigde met de finale op 12 april 2004 in het St. Jakob-Park in Basel. FC Wil won de beker voor de eerste keer in de clubgeschiedenis. In de finale was de club met 3-2 te sterk voor Grasshopper Club Zürich.

12 april 2004 – St. Jakob-Park, Bazel 22.500 toeschouwers Scheidsrechter: Guido Wildhaber
Grasshopper Club Zürich	2 – 3	FC Wil
Richard Núñez  8' Ricardo Cabanas  19'	goals	5' Rogério  30' (pen.) Fabinho  79' (pen.) Fabinho
Alain Geiger	Trainer-coach	Joachim Müller
Fabrice Borer Pascal Castillo Reto Ziegler Stephan Lichtsteiner 45' Aleksandar Mitreski Christoph Spycher Mihai Tararache Richard Núñez Ricardo Cabanas 80' Eduardo Ionel Gane 46'	opstellingen	Daniel Lopar Stefan Blunschi Patrick Winkler Philippe Montandon 38' Massimo Rizzo Michel Renggli Davide Callà Fabinho Kristian Nushi 90+1' Rogério Felix Mordeku
Carlos da Silva 45' Kim Jaggy 46' Mladen Petrić 80'	wissels	38' Stephan Balmer 90+1' Nenad Savić
Stephan Lichtsteiner 39' Christoph Spycher 62' Aleksandar Mitreski 78'	gele kaarten	88' Stefan Blunschi
Mihai Tararache  25', 45'	rode kaarten

• Axpo Super League 2003/04
• Challenge League 2003/04
• Zwitsers voetbalelftal in 2003
• Zwitsers voetbalelftal in 2004