Tijdens de 19e-eeuwse turfwinning werden heel wat Romeinse stukken gevonden, wat wijst op Romeinse aanwezigheid. In die tijd werd immers in het naburige Leffinge aan zoutwinning gedaan en een 10-tal kilometer daarvandaan was het belangrijk Romeinscastellum van Oudenburg gevestigd.
Opgravingen wijzen op de eerste bewoning in de 10e tot 12e eeuw. In de 13e eeuw werd voor het eerst een parochie vermeld in de annalen van de Gentse Sint-Pietersabdij. In de 14e eeuw werd Zevekote vermeld als centrum van de heerlijkheid Guysen. Tot 1540 was deze in bezit van het geslacht Halewijn, vervolgens Claerhout, daarna Zuniga Y Mendosa en uiteindelijk het Huis Croÿ.
Guysen was een baronie die in 1715 tot hertogdom werd verheven. Alexander de Croy was de eerste hertog. In 1795 werd de heerlijkheid Guysen opgeheven.
Op 31 maart 2017 werd het rampenplan afgekondigd en het gehele dorp ontruimd nadat er een gifwolk ontstond door een lek in een opslagtank met salpeterzuur op het terrein van een mestverwerkend bedrijf.[1]
Demografische ontwikkeling
Bronnen:NIS, Opm:1831 tot en met 1970=volkstellingen
Bezienswaardigheden
In het dorp staat de Onze-Lieve-Vrouwekerk, die op 8 september1719 door Mgr. Van Susteren werd ingewijd. De plattegrond van de kerk heeft de vorm van een Grieks kruis. De westertoren is recenter en dateert uit 1856, en contrasteert zo met de rest van de kerk.
Zevekote ligt op een dekzandrug die hoger ligt dan het omringende polderlandschap. De hoogte bedraagt ongeveer 2,5 meter. Een deel van de omgeving werd verveend, waardoor laagtes ontstonden zoals het Rietbos.
Politiek
Zevekote had een eigen gemeentebestuur en burgemeester tot de gemeentelijke fusie van 1971. Burgemeesters waren: