Wenceslaus was de achtste zoon van keizer Maximiliaan II en Maria van Spanje, dochter van keizer Karel V en Isabella van Portugal.
Op 16-jarige leeftijd werd hij aangesteld als grootprior van Castilië in de Orde van Malta, wat leidde tot veel wrijving binnen de Orde. Lang kon hij niet van zijn functie genieten.
Wensceslaus stierf op 22 september 1578 te Madrid, zijn lichaam werd bijgezet in het Escorial.
Voorouders
Voorouders van Wenceslaus van Oostenrijk (1561-1578)