Het Bosnisch voetbalelftal speelde in totaal negen officiële interlands in het jaar 1999, waaronder zes wedstrijden in de kwalificatiereeks voor de EK-eindronde 2000 in België en Nederland. Bosnië en Herzegovina eindigde als vierde in groep 9 en wist zich daardoor niet te plaatsen voor het hoofdtoernooi.

De ploeg stond bij het begin van het jaar onder leiding van bondscoach Džemaludin Mušović, maar hij moest het veld ruimen na de 2-1 nederlaag in de oefeninterland tegen Malta op 27 januari. Hij werd opgevolgd door oud-international Faruk Hadžibegić. Op de in 1993 geïntroduceerde FIFA-wereldranglijst steeg Bosnië in 1999 van de 97ste (januari 1999) naar de 75ste plaats (december 1999).

Wedstrijden				Doelpunten			Punten
Gespeeld	Winst	Gelijk	Verlies	Voor	Tegen	Saldo
9	3	3	3	14	9	+5	1.000

27 januari Vriendschappelijk № 25 «onderlinge duels»	Malta [1]	2 – 1[2]	Bosnië en Her.[3]	Ta' Qali Stadium, Ta' Qali Toeschouwers: 1.000 Scheidsrechter: Marco Tura (SMR)
	David Carabott  45' Carmel Busuttil  84'		29' Hasan Salihamidžić

10 maart Vriendschappelijk № 26 «onderlinge duels»	Hongarije	1 – 1	Bosnië en Her.[4]	Stadion Üllői út, Boedapest Toeschouwers: 7.792 Scheidsrechter: Martin Ingvarsson (SWE)
	Bela Illés  66' (pen.)		31' Meho Kodro

5 juni EK-kwalificatie № 27 «onderlinge duels» 20:30 uur	Bosnië en Herz.	2 – 0[5]	Litouwen	Stadion Koševo, Sarajevo Toeschouwers: 6.100 Scheidsrechter: Arturo Daudén Ibáñez (ESP)
	Meho Kodro  26' (pen.) Elvir Bolić  90'

9 juni EK-kwalificatie № 28 «onderlinge duels» 19:00 uur	Faeröer	2 – 2	Bosnië en Her.[6]	Svangaskarð, Toftir Toeschouwers: 4.600 Scheidsrechter: Peter Jones (ENG)
	Uni Arge  38' Uni Arge  49'		14' Elvir Bolić  50' Elvir Bolić

18 augustus Vriendschappelijk № 29 «onderlinge duels»	Liechtenstein	0 – 0	Bosnië en Her.[7]	Rheinpark Stadion, Vaduz Toeschouwers: 1.300 Scheidsrechter: Massimo Busacca (SUI)

4 september EK-kwalificatie № 30 «onderlinge duels» 20:30 uur	Bosnië en Herz. [8]	1 – 2	Schotland	Stadion Koševo, Sarajevo Toeschouwers: 26.000 Scheidsrechter: Nikolai Levnikov (RUS)
	Elvir Bolić  23'		14' Don Hutchison  50' Billy Dodds

8 september EK-kwalificatie № 31 «onderlinge duels»	Tsjechië	3 – 0	Bosnië en Her.	Na Stínadlech, Teplice Toeschouwers: 10.125 Scheidsrechter: Karl-Erik Nilsson (SWE)
	Jan Koller  26' Patrik Berger  59' (pen.) Karel Poborský  67'

5 oktober EK-kwalificatie № 32 «onderlinge duels» 20:00 uur	Schotland	1 – 0	Bosnië en Her.[9]	Hampden Park, Glasgow Toeschouwers: 30.574 Scheidsrechter: Leif Sundell (SWE)
	John Collins  26'

9 oktober EK-kwalificatie № 33 «onderlinge duels» 16:00 uur	Estland	1 – 4	Bosnië en Her.[10]	Kadrioru Stadion, Tallinn Toeschouwers: 1.200 Scheidsrechter: Roelof Luinge (NED)
	Andres Oper  4'		42' Elvir Baljić  57' Elvir Baljić  67' Elvir Baljić  87' Elvir Baljić

JAN	FEB	MAR	APR	MEI	JUN	JUL	AUG	SEP	OKT	NOV	DEC
97	98	97	97	96	90	90	90	89	76	74	75

Naam	Geboren	Club	Interlands			Totaal
			Duels	Invalb.	Goals	Interlands	Goals
Doel
Dedić, Mirsad Mirsad Dedić	1968-02-21	NK Đerzelez	5	1	0	25	0
Gušo, Adnan Adnan Gušo	1975-11-30	Erzurumspor	2	0	0	2	0
Pejković, Nihad Nihad Pejković	1968-10-23	Olimpija Ljubljana	1	0	0	2	0
Verdediging
Varešanović, Mirza Mirza Varešanović	1972-05-31	Bursaspor	6	0	0	16	0
Hibić, Mirsad Mirsad Hibić	1973-10-11	Sevilla FC	5	0	0	12	0
Kapetanović, Sead Sead Kapetanović	1972-01-21	Borussia Dortmund	4	0	0	13	0
Konjić, Muhamed Muhamed Konjić	1970-05-14	Coventry City	4	0	0	18	0
Mujdža, Jasmin Jasmin Mujdža	1974-03-02	Hajduk Split	3	0	0	8	0
Hujdurović, Faruk Faruk Hujdurović	1970-05-14	SV Ried	2	0	0	2	0
Nedić, Dalibor Dalibor Nedić	1974-11-10	FK Rudar Kakanj	1	0	0	1	0
Rizvić, Munever Munever Rizvić	1973-11-04	FK Budućnost Banovići	1	0	0	1	0
Mulalić, Edis Edis Mulalić	1975-10-25	FK Željezničar	0	1	0	1	0
Middenveld
Beširević, Bakir Bakir Beširević	1965-11-03	NK Osijek	6	0	0	18	0
Šabić, Nermin Nermin Šabić	1973-12-21	Dinamo Zagreb	5	1	0	19	0
Repuh, Senad Senad Repuh	1972-11-18	FK Sarajevo	4	2	0	14	1
Ihtijarević, Faruk Faruk Ihtijarević	1976-05-01	Bosna Visoko	4	1	0	5	0
Mujčin, Edin Edin Mujčin	1970-01-14	Dinamo Zagreb	3	3	0	15	1
Joldić, Omer Omer Joldić	1977-01-01	Sloboda Tuzla	3	2	0	5	0
Smajić, Edin Edin Smajić	1971-08-30	NK Iskra Bugojno	3	0	0	4	0
Salihamidžić, Hasan Hasan Salihamidžić	1977-01-01	Bayern München	2	0	1	15	4
Halilović, Sejad Sejad Halilović	1969-03-16	Altay Izmir	2	0	0	14	0
Hasančić, Admir Admir Hasančić	1970-11-29	HNK Rijeka	1	0	0	2	0
Avdić, Alen Alen Avdić	1977-04-03	FK Sarajevo	0	3	0	3	0
Muratović, Samir Samir Muratović	1976-02-25	FK Željezničar	0	3	0	3	0
Demirović, Enes Enes Demirović	1972-06-13	İstanbulspor	0	2	0	11	0
Duro, Samir Samir Duro	1977-10-18	FK Sarajevo	0	1	0	1	0
Osmanhodzić, Adnan Adnan Osmanhodzić	1971-05-24	Sloboda Tuzla	0	1	0	1	0
Aanval
Topić, Marko Marko Topić	1976-01-01	AC Monza Brianza	6	1	0	11	1
Bolić, Elvir Elvir Bolić	1971-10-10	Fenerbahçe	4	2	4	20	10
Kodro, Meho Meho Kodro	1967-01-12	Deportivo Alavés	4	0	2	12	3
Barbarez, Sergej Sergej Barbarez	1971-09-17	Borussia Dortmund	3	0	0	8	1
Turković, Almir Almir Turković	1970-11-03	NK Osijek	2	1	0	10	0
Baljić, Elvir Elvir Baljić	1974-07-08	Fenerbahçe	2	0	4	15	5