Misidjan werd al op jonge leeftijd gescout door Willem II en doorliep in Tilburg de gehele jeugdopleiding. In de voorbereiding op de tweede seizoenshelft 2011/2012 trainde hij een aantal keer mee met het eerste elftal van Willem II. Ook mocht hij, net als andere jeugdspeler Jeroen Lumu, mee op trainigskamp naar het Turkse Belek. De aanvaller maakte na de winterstop zijn debuut, in de competitiewedstrijd uit tegen FC Den Bosch op 29 januari 2012 (1–0 nederlaag) kwam hij in de 83e minuut in het veld als vervanger van Robbie Haemhouts. Op 16 augustus 2013 werd bekend dat Misidjan een driejarig contract had ondertekend bij de Bulgaarse club PFK Ludogorets. Misidjan werd verkocht voor €700.000,–. Misidjan speelde 54 officiële wedstrijden in de Tilburgse hoofdmacht waarin hij 10 keer scoorde. In de vijf seizoenen in Bulgarije speelde hij 132 wedstrijden waarin hij 32 doelpunten maakte. Zijn debuut in de Europese competities vond plaats op 21 augustus2013 in de voorronde Champions League tegen FC Basel (2–4 verlies). Zijn eerste Europees doelpunt maakte hij op 19 september van datzelfde jaar in de Europa League uit tegen PSV (0–2 winst). Na vijf seizoenen bij Ludogorets maakte hij de overstap naar de Duitse club 1. FC Nürnberg[1]. Na tweeënhalf seizoen met veelal blessureleed in de laatste 18 maanden keerde hij in 2021 terug naar Nederland om te gaan voetballer voor PEC Zwolle[2]. Hij maakte een transfervrije overstap nadat zijn contract met de Duitse club was ontbonden.
Op 10 juni 2021 tekende Misidjan een contract voor 2 seizoenen bij FC Twente.