De Verkiezingen voor het Europees Parlement 1999 waren de vijfde verkiezingen voor een rechtstreeks gekozen Europees Parlement, voor de zittingsperiode 1999-2004. Zij vonden plaats van 10 t/m 13 juni 1999. Er werd in alle 15 lidstaten gestemd voor in totaal 626 parlementsleden.
In België werden de verkiezingen gehouden op 13 juni, in Nederland op 10 juni.