Het seizoen 1968/1969 was het 14e jaar in het bestaan van de Vlaardingense betaald voetbalclub Fortuna. De club kwam uit in de Nederlandse Tweede divisie en eindigde daarin op de derde plaats, dit betekende rechtstreekse promotie naar de Eerste divisie. Tevens deed de club mee aan het toernooi om de KNVB beker, hierin werd de club in de eerste ronde, na verlenging, uitgeschakeld door MVV (0–1).