Het UEFA Cup-toernooi van 2006/07 is het 36e seizoen in (inmiddels) het op een na belangrijkste Europese club-voetbaltoernooi. De voorrondes begonnen op donderdag 13 juli. Het hoofdtoernooi begon op donderdag 14 september. De finale werd gespeeld op 16 mei2007 in Hampden Park in Glasgow. De Spaanse titelhouder Sevilla FC haalde opnieuw de beker binnen.
België wordt vertegenwoordigd door drie clubs: bekerwinnaar Zulte Waregem dat zich direct plaatste, Club Brugge (nummer drie van de Jupiler League) dat zich via de tweede kwalificatieronde plaatste en Standard Luik dat na de uitgeschakeling in de derde voorronde van de Champions League weer werd opgevist in de UEFA Cup.
KSV Roeselare werd als fairste club (na RSC Anderlecht) in een van de fairste competities van de UEFA uitgeloot voor een plaats in de eerste kwalificatieronde. Die ronde overleefden ze, maar in de tweede kwalificatieronde werd was Ethnikos Achna uit Cyprus te sterk.
Kwalificatierondes
Eerste voorronde
Uit de loting voor de eerste kwalificatieronde zijn de volgende wedstrijden ontstaan. De winnaars over de heen- en terugwedstrijd plaatsten zich voor de tweede kwalificatieronde. De heenwedstrijden waren op donderdag 13 juli, de terugwedstrijden twee weken later; op donderdag 27 juli.
De wedstrijden in de tweede kwalificatieronde werden op dinsdag 8 en donderdag 10 augustus afgewerkt. De returns vonden plaats op donderdag 24 augustus.
De wedstrijd Hapoel Tel Aviv - Domžale werd in verband met de crisis in het Midden-Oosten in het Willem II-Stadion in Tilburg gespeeld.
De wedstrijd Bnei Jehoeda - Lokomotiv Sofia werd in verband met de crisis in het Midden-Oosten in Senec, Slowakije gespeeld.
De wedstrijd Beitar Jerusalem - Dinamo Boekarest werd in verband met de crisis in het Midden-Oosten in Sofia, Bulgarije gespeeld.
Eerste ronde
De loting van vrijdag 25 augustus in Monaco voor de eerste ronde had de volgende wedstrijden als uitslag:
De heen-wedstrijden werden op donderdag 14 september gespeeld en de terug-wedstrijden op donderdag 28 september. De vetgedrukte teams gingen door naar de groepsfase.
1 De wedstrijd Maccabi Haifa - Litex Lovetsj werd in De Goffert in Nijmegen gespeeld vanwege de cricis in het Midden-Oosten. 2 De wedstrijd Vitória Setúbal - Heerenveen werd in Estádio José Alvalade XXI in Lissabon gespeeld. Het eigen Estádio do Bomfim voldeed niet aan de gestelde UEFA-eisen.
Tweede ronde
De loting voor de tweede ronde werd gehouden op 3 oktober2006 in het hoofdkantoor van de UEFA in Nyon, Zwitserland.
Beslissingscriteria
Wanneer teams na het beëindigen van de groepsfase met evenveel punten eindigen, worden een aantal opeenvolgende criteria overlopen tot een verschil wordt gevonden en men de twee ploegen kan ordenen:
Het doelpuntensaldo over alle groepswedstrijden.
Meeste doelpunten gescoord in alle groepswedstrijden.
Meeste doelpunten gescoord in alle uitwedstrijden.
De teams in de linkerkolom beginnen met een thuiswedstrijd. De eerste wedstrijd werd gespeeld op 14 en 15 februari, de returns op 22 februari.
Het speelschema voor de derde ronde is als volgt:
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
.svg){kind=small}
