Het seizoen 2016/17 van de BelgischeTweede klasse amateurs gaat van start in september 2016 en eindigt in mei 2017. Daarna worden nog eindrondes voor promotie naar Eerste klasse amateurs en degradatie naar Derde klasse amateurs afgewerkt. De competitie telt 3 reeksen van 16 ploegen. Twee reeksen met clubs, aangesloten bij de VFV en één reeks met clubs aangesloten bij de ACFF. De nieuwe competitie werd samengesteld uit de teams uit de voormalige Derde klasse die niet voor promotie of degradatie in aanmerking kwamen.
Bijgewerkt tot wedstrijd(en) gespeeld op einde seizoen. Bron: [bron?] Noten:
↑KFC Sparta Petegem eindigde tweede en kwam in aanmerking voor de promotie-eindronde, maar vroeg geen licentie aan. KFC Izegem en KSV Temse vroegen evenmin een licentie aan. Hierdoor gingen de resterende eindrondeplaatsen naar K. Olsa Brakel en KRC Gent.
Bijgewerkt tot wedstrijd(en) gespeeld op einde seizoen. Bron: [bron?]
Noot: Behalve de top 3 vroegen er geen andere teams een licentie aan. Daardoor waren er maar twee teams uit deze reeks die zouden deelnemen aan de eindronde voor promotie.
Bijgewerkt tot wedstrijd(en) gespeeld op einde seizoen. Bron: [bron?]
Noot: Behalve de top 4 vroegen er geen andere teams een licentie aan. Daardoor waren er maar drie teams uit deze reeks die zouden deelnemen aan de eindronde voor promotie.
De eindronde werd gespeeld door de teams die tweede waren geëindigd in het eindklassement en de drie periodekampioenen. Indien één of meerdere periodes gewonnen werden door de uiteindelijke kampioen of door dezelfde club, kreeg de best geklasseerde ploeg zonder eindrondeticket een plek in de eindronde.
Eerste ronde
Op de eerste speeldag traden normaal acht teams aan. Doordat slechts zes teams een licentie kregen of wilden, waren KRC Gent en K. Olsa Brakel vrij in de eerste ronde. De wedstrijden werden gespeeld op het veld van de club die bij de lottrekking als eerste geloot werd. In een rechtstreeks duel (met eventuele verlengingen en strafschoppen) werd bepaald wie naar de tweede ronde mocht.
De twee clubs die het in de tweede ronde haalden, plaatsten zich voor een nieuwe eindronde met de nummer 13 uit Eerste klasse amateurs (K. Sporting Hasselt) en de winnaar van de ACFF-eindronde.
De eindronde werd gespeeld door de teams die tweede waren geëindigd in het eindklassement en de drie periodekampioenen. Indien één of meerdere periodes gewonnen werden door de uiteindelijke kampioen of door dezelfde club, kreeg de best geklasseerde ploeg zonder eindrondeticket een plek in de eindronde.
Eerste ronde
Op de eerste speeldag traden normaal vier teams aan. Doordat slechts drie teams een licentie kregen of wilden, was RFC Liège vrij in de eerste ronde. De wedstrijden werden gespeeld op het veld van de club die bij de lottrekking als eerste geloot werd. In een rechtstreeks duel (met eventuele verlengingen en strafschoppen) werd bepaald wie naar de tweede ronde mocht.
Bij de drie teams die zich kwalificeerden voor de eindronde werd de nummer 13 uit Eerste klasse amateur gevoegd: K. Sporting Hasselt. De vier geplaatste clubs konden via een heen- en terugwedstrijd een ticket voor de finale bemachtigen. Indien er na 180 minuten geen winnaar was, volgden eventueel verlengingen en strafschoppen.
De twee ploegen die veertiende eindigden in Tweede klasse amateurs VFV moesten in een rechtstreeks duel bepalen wie in Tweede klasse amateurs zou blijven en wie zou zakken naar Derde klasse amateurs. KVK Tienen ging met 1-4 winnen tegen KSV Bornem en redde zich zo, maar ook KSV Bornem bleef in Tweede klasse amateurs omdat er met KVV Coxyde en K. Sporting Hasselt slechts twee Vlaamse clubs degradeerden uit Eerste klasse amateurs.