Thomas Phelippes (1556-1625) was een 16e-eeuws Engels spion en codebreker. Hij is de oudst bekende Engelse cryptoanalist. Na zijn opleiding in Cambridge tot taalspecialist treedt hij in dienst van Amias Paulet, de afgevaardigde in Parijs voor Elizabeth I van Engeland. Later wordt hij gerekruteerd door Francis Walsingham, Elizabeths spionagemeester. Onder hem speelt Phelippes een belangrijke rol in het Babingtoncomplot. Hij ontcijfert in juli 1586 het substitutiegeheimschrift van Maria I van Schotland. Mede hierdoor wordt deze veroordeeld voor hoogverraad.

• The codebreakers, the comprehensive history of secret communication from ancient times to the internet (herziene uitgave 1996) - David Kahn ISBN 0684831309
• Cryptology and statecraft in the Dutch Republic - Karl de Leeuw ISBN 9057760398
• Spies & spymasters, a concise history of intelligence - Jock Haswell ISBN 0500011788