Het ordinariaat verzorgt de zielzorg van de katholieke manschappen onder de Slowaakse Strijdkrachten. Het werd door paus Johannes Paulus II opgericht op 20 januari 2003. Van 2003 tot 2009 was de Drievuldigheidskerk in Bratislava kathedraal van het ordinariaat. Vanaf 2009 is dit de Heilige Sebastiaanskathedraal in de hoofdstad.
