Dit artikel geeft een chronologisch overzicht van alle belangrijke gebeurtenissen per dag in de maand september van het jaar 1999.

• In een spectaculaire oefenwedstrijd in De Kuip speelt het Nederlands voetbalelftal met 5-5 gelijk tegen België. Patrick Kluivert scoort drie keer voor Oranje. België telt twee debutanten: Frédéric Herpoel (KAA Gent) en Jacky Peeters (Arminia Bielefeld).

• Bij een aardbeving van 5,9 op de schaal van Richter in Athene komen 143 mensen om het leven.

• De Sega Dreamcast komt uit in de Verenigde Staten.

• De Poolse wielrenner Tomasz Brożyna wint de 56ste editie van de Ronde van Polen.
• In Montreal behaalt de Kazachse triatleet Dmitriy Gaag de wereldtitel olympische afstand. Bij de vrouwen gaat de zege naar de Australische Loretta Harrop.

• Kiribati, Tonga en Nauru worden lid van de Verenigde Naties.

• Op de nieuwste FIFA-wereldranglijst bezet Brazilië de eerste plaats, gevolgd door Tsjechië en Frankrijk.

• Het televisieprogramma Big Brother gaat van start in Nederland.

• Bij een aardbeving van 7,3 op de schaal van Richter in het centrale deel van Nántóu in Taiwan komen ongeveer 2400 mensen om het leven.

Zie de categorie September 1999 van Wikimedia Commons voor mediabestanden over dit onderwerp.