Pamele ontwikkelde zich vanaf de 12e eeuw (eerste vermelding in 1160) als een zelfstandige kleine stad met stadsrechten (vanaf 1226) op de rechteroever van de rivier, tegenover Oudenaarde. Het domein waarop de stad ontstond, was eigendom van de Heren van Oudenaarde en Pamele.
Pamele bestond tot op het einde van de 16e eeuw als een aparte stad en werd stapsgewijs een geheel met Oudenaarde. Pamele verdween in 1593 als zelfstandige entiteit toen het met Oudenaarde versmolt. Deze versmelting is terug te vinden in het wapenschild van Oudenaarde: bij de samenvoeging van de twee steden heeft men de Vlaamse leeuw (Oudenaarde) en rode dwarse strepen (Pamele) in het wapenschild gezet.