De marathon van Praag 2012 werd gelopen op zondag 13 mei 2012. Het was de achttiende editie van deze marathon.

De Ethiopiër Deressa Chimsa passeerde bij de mannen de finish als eerste in 2:06.25. Hij verbeterde hiermee het parcoursrecord. De Keniaan Stephen Tum werd met 2:07.16 tweede en verbeterde hiermee zijn persoonlijk record. Zijn landgenoot Philemon Limo debuteerde op de marathon in 2:09.25. Bij de vrouwen zegevierde Agnes Kiprop uit Kenia in 2:25.41.

Deze editie was net als voorgaande edities het toneel van het Tsjechische kampioenschap op de klassieke afstand. De nationale titels werden ditmaal gewonnen door respectievelijk Jan Kreisinger (dertiende in 2:16.26) en Petra Pastorova (negende in 2:39.42).

In totaal finishten 5624 lopers, waarvan 908 vrouwen.

rang	naam	land	tijd
1	Deressa Chimsa	ETH	2:06.25
2	Stephen Tum	KEN	2:07.16
3	Philemon Limo	KEN	2:09.25
4	Francis Bowen	KEN	2:10.05
5	Nephat Kinyanui	KEN	2:11.06
6	Julius Arile Lomerinyang	KEN	2:12.13
7	Wirimai Juwawo	ZIM	2:14.38
8	Teferei Bacha	ETH	2:14.38
9	Niguse Chala	ETH	2:14.42
10	Yared Dagnaw	ETH	2:15.00
11	Yossef Gezachw	ISR	2:15.07
12	Lema Feyisa	ETH	2:15.25
13	Jan Kreisinger	CZE	2:16.26
14	Fernando Silva	POR	2:17.04
15	Adam Kovacs	HUN	2:18.48

rang	naam	land	tijd
1	Agnes Kiprop	KEN	2:25.41
2	Flomena Chepchirchir	KEN	2:26.50
3	Meseret Debekle	ETH	2:27.15
4	Souad Aït Salem	ALG	2:27.21
5	Misiker Mekonnin	ETH	2:29.46
6	Silvia Skvortsova	RUS	2:30.27
7	Iullia Arkhipova	KGZ	2:30.58
8	Tsega Gelaw	ETH	2:38.28
9	Petra Pastorova	CZE	2:39.42
10	Miriam van Reijen	NED	2:48.39