Op 1 januari 1991 fuseerde deze gemeente met Benthuizen en Koudekerk aan den Rijn tot de nieuwe gemeente Rijneveld, waarvan de naam twee jaar later werd gewijzigd in Rijnwoude.
Tot 1 januari 2014 was Rijnwoude een zelfstandige gemeente, sindsdien behoort het tot de fusiegemeente Alphen aan den Rijn.
