Het seizoen 1965/1966 was het 12e jaar in het bestaan van de Haarlemse betaald voetbalclub EDO. De club kwam uit in de Tweede divisie B en eindigde daarin op de 15e plaats. Tevens deed de club mee aan het toernooi om de KNVB beker, hierin werd de club in de groepsfase uitgeschakeld.