De European Nations Cup Derde Divisie 2004/06 is het 5e seizoen van de Derde Divisie van de Europe Nations Cup, de op twee na en tevens het laagste niveau in de ENC.
De Derde Divisie bestaat uit 4 groepen (3A, 3B, 3C en 3D) waarvan de hoogste drie uit 5 landen bestaan en de laagste uit 2 landen. De Divisies A, B en C spelen een halve competitie waarna de kampioenen promoveren en de laatst geëindigde landen degraderen.
De twee landen in Divisie D spelen twee maal tegen elkaar waarna de winnaar over de twee wedstrijden promoveert naar Divisie 3C.
De eerste helft van het seizoen werd er gestreden om plaatsing voor het Wereldkampioenschap rugby 2007. De landen die na de tweede ronde waren uitgeschakeld werden geplaatst in de Derde Divisie voor de tweede helft van het seizoen.
In het eerste helft van het seizoen werd er, samen met de landen uit de Tweede Divisie gestreden om plaatsing voor het WK. De landen die niet meededen of na de tweede ronde niet meer meededen, deden in de tweede jaar van het seizoen mee in de Derde Divisie.
De volgende landen plaatste zich voor de Derde Divisie 2005/06
* Hiermee wordt bedoeld de landen die niet hebben deelgenomen aan de kwalificatie.
Divisie 3B-Divisie 3C Play-offs
Zes landen plaatste zich via de WK kwalificatie voor de play-offs om te bepalen welke twee landen naar Divisie 3B gaan en welke vier landen naar Divisie 3C gaan.