Op 8 januari 1570 huwde ze in Küstrin met Joachim Frederik van Brandenburg (1546-1608), die in 1598 keurvorst van Brandenburg werd. Door het huwelijk had Joachim Frederik geen legitieme aanspraken meer op het katholieke aartsbisdom Maagdenburg.
Catharina was de eerste keurvorstelijke bewoonster van het Slot van Caputh. Ze zette zich in voor armen en noodlijdenden. In Wedding liet ze een melkfabriek bouwen, waarvan de producten verkocht werden op de Berlijnse Melkmarkt. Met de opbrengst richtte ze een apotheek op, waar armen gratis geneesmiddelen konden verkrijgen.
Catharina stierf op 53-jarige leeftijd. Ze werd bijgezet in de crypte van de Hohenzollerns in de Dom van Berlijn.
Nakomelingen
Catharina en haar echtgenoot Joachim Frederik kregen elf kinderen: