Paus Franciscus zelf zou oorspronkelijk in 2020 een bezoek brengen aan Indonesië, als onderdeel van een apostolische reis waarbij ook Oost-Timor en Papoea-Nieuw-Guinea zouden worden aangedaan. Het bezoek was bedoeld om de interreligieuze dialoog te bevorderen, wat vooral belangrijk was gezien de status van Indonesië als het land met de grootste moslimmeerderheid. Er werd verwacht dat het bezoek de banden tussen verschillende religieuze gemeenschappen zou versterken, vooral tussen katholieken en moslims. Het bezoek werd echter afgelast vanwege de Coronapandemie. Reisbeperkingen, gezondheidszorgen en de noodzaak om grote bijeenkomsten te vermijden dwongen het Vaticaan om de plannen aan te passen. Er werd op dat moment geen nieuwe datum aangekondigd en toekomstige plannen zijn afhankelijk van de wereldwijde situatie.[5][6]
In 2024 heeft de Indonesische regering bij monde van PresidentJoko Widodo, een officiële uitnodiging aan de Heilige Stoel voor het bezoek.[7] Deze uitnodiging werd op 25 maart 2024 officieel overhandigd door aartsbisschop Piero Pioppo, de Apostolische Nuntius in Indonesië. Het vierdaagse bezoek aan Indonesië, van 3 tot 6 september, markeert zijn 45e internationale reis en is daarmee de langste van zijn pausdom.[8] Eerder meldden sommige bronnen dat paus Franciscus ook Oost-Nusa Tenggara en West-Kalimantan zal bezoeken. Dit werd later echter uit het schema geschrapt omwille van de beknoptheid.[9]